wiki:biocluster

Version 18 (modified by wade, 15 years ago) (diff)

--

【Schedular】

  1. 2009-09-04 13:30 跟陽明視訊開會。
  2. 2009-09-11 第一階段軟體安裝。
  3. 2009-09-14 系統測試、種子學員。

【Environment】

  • OS:Ubuntu 8.04.3 LTS

【Software list】

  1. Matlab?
  2. AutoFACT
  3. BLAST
  4. SIM4
    • 提供 sample 及 結果 供測試。
  5. Clustal
    • 提供 sample 及 結果 供測試。
  6. PipMaker
    • 提供 sample 及 結果 供測試。
    • 設定較複雜。
  7. Phylip
  8. Eland
  9. Velvet
    • 提供 sample 及 結果 供測試。
    • doc 建議使用 64 BITS CPU。
  10. Bowtie
    • 提供 sample 及 結果 供測試。
    • BINARY FILE。
  11. SOAP

【Database list】

  1. Human dbEST database
  2. Human UniGene? database
  3. Protein interaction database
  4. Gene ontology database
  5. Homologene database

【LOG】