​http://globin.bx.psu.edu/html/docs/sim4.html

【說明】

比對 dna 序列及基因序例，以 blast-base 。

【安裝】

   wget http://globin.cse.psu.edu/ftp/dist/sim4/sim4.tar.gz
   tar zxvf sim4.tar.gz
   cd sim4.2002-03-03/
   make

【路徑】

   /opt/sim4/

【測試】

   sim4 query_test.txt reference.fasta

【結果】

   seq1 = query_test.txt, 25 bp
   seq2 = reference.fasta (scaffold00001), 4743 bp

   1-25  (2326-2350)   100%