wiki:biocluster/AutoFACT

AutoFACT

執行 AutoFACT 的系統需要有: Perl, BioPerl-1.4 (這個是perl下的module), 還有BLAST這樣就可以了

【說明】

【安裝】

  1. 下載及安裝:
       sudo apt-get install bioperl
       cd /opt
       wget http://www.bch.umontreal.ca/Software/AutoFACT_v3_4.tar
       tar xvf AutoFACT_v3_4.tar
       mv AutoFACT autofact
       cd autofact
    
  2. 設定路徑:
       echo "export PATH2AUTOFACT=/opt/AutoFACT" >> /etc/profile
       source /etc/profile
    
  3. 下載資料庫:
       cd /opt/autofact
       mkdir db_files
       cd db_files
       sudo perl /opt/autofact/scripts/downloads_4_AutoFACT.pl
    

【路徑】

   /opt/autofact/

【測試】

【結果】

Last modified 14 years ago Last modified on Dec 10, 2009, 3:08:36 PM