wiki:jazz/09-05-22

2009-05-22

  • [專案] 陽明生物資訊叢集設定
    • (1) 每個節點都需要載入核心模組 ldiskfs 與 lnet,作法是加入 /etc/modules。
      # /etc/modules: kernel modules to load at boot time.
      loop
      usbkb
      lustre
      ldiskfs
      lnet
      
    • (2) 幫 DRBL Server 設定 lnet 的網路參數,作法是在 /etc/modprobe.d/ 加上 lnet 的 options 參數
      bio:~# cat > /etc/modprobe.d/lnet  << EOF
      options lnet ip2nets="tcp(eth1) 192.168.129.1"
      EOF
      
    • (3) 幫 DRBL Client 設定 lnet 的網路參數
      bio02:~# echo "options lnet networks=tcp" > /etc/modprobe.d/lnet
      
    • (4) 確認每一台節點都已經載入 ldiskfs 與 lnet 核心模組
      ~# lsmod | grep ldiskfs
      ~# lsmod | grep lnet
      
    • (5) 確認 lnet 網路參數正確
      ~# lctl network up
      ~# lctl list_nids
      
    • (6) 在 DRBL Server 上啟動 MDT/MGS 節點
      bio:~# mkfs.lustre --reformat --fsname=bio --mdt --mgs /dev/sdb1
      bio:~# mkdir -p /mnt/mdt
      bio:~# mount -t lustre /dev/sdb1 /mnt/mdt
      
    • (7) 啟動 OST 節點
      bio102:~# mkfs.lustre --reformat --fsname=bio --ost --mgsnode=192.168.129.1@tcp /dev/sda
      bio102:~# mkfs.lustre --reformat --fsname=bio --ost --mgsnode=192.168.129.1@tcp /dev/sdb
      bio102:~# mkdir -p /mnt/ost
      bio102:~# mount -t lustre /dev/sda /mnt/ost/
      bio102:~# mount -t lustre /dev/sdb /mnt/ost/
      
  • cdpr - 一套可以拿來查 Cisco Switch 型號跟網路線接在哪一個埠(Port)的工具 - 有 debian 套件

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