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| 3 | * 演講準備 - 蒐集 HPC, Cloud Computing, Map/Reduce 與生物資訊相關運用參考資料 |
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| 5 | * [https://sourceforge.net/projects/octaveoncloud/ Octave as Cloud Service] - Octave 是一套類似 Matlab 的自由軟體,其實這個專案的 idea 挺不錯的,教學上如果多採用 Octave 的話,就不會造成學校或實驗室在 Matlab 授權/非法侵權的問題。當然我覺得如果熟悉網頁設計跟 VNC 這個服務應該不難做出來才對。 |
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| 7 | == Clustering / Distributed Computing / Bioinformatics == |
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| 9 | * [https://sourceforge.net/search/index.php?words=trove%3A(252)+AND+trove%3A(141)&type_of_search=soft&pmode=0&filtermanip=1&gfload=&gfnew=&inex=1&sortselect=has_file%3Atrue®istration_date__0=&trove__225=456&trove__274=369&trove__160=584&trove__199=426&trove__13=14&trove__1=534&trove__6=7&trove__496=499&newfilter=Apply 同時歸類在 Bioinformatics 與 Clustering 又有檔案可以下載的 SourceForge 專案] |
| 10 | * [http://lucene.apache.org/java/2_3_1/queryparsersyntax.html SourceForge 搜尋關鍵字的語法是用 Lucene] |
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| 12 | * [http://hubris.ucsd.edu/dapper/ Dapper] - The Distributed and Parallel Program Execution Runtime |
| 13 | * 在 SourceForge 的 Clustering Topic 軟體中,Ranking 算蠻高的。 |
| 14 | * [http://proactive.inria.fr/ ProActive] - Open Source middleware (OW2 consortium) for parallel, distributed, multi-core computing. - 法國的一個專案,目的似乎在簡化建立平行/分散/多核心叢集的工作 |
| 15 | * [http://gridder.sourceforge.net/ Gridder] - 基於 Globus 的 Web Service Portlet ... 跟 Grid Portal 很像 :p |
| 16 | * [http://www.uscms.org/SoftwareComputing/Grid/WMS/glideinWMS/ glideinWMS] - The glidein based WMS |
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| 18 | == Open Source : Bioinformatics == |
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| 20 | * [http://libseq.sourceforge.net/ C++ Bio Sequence Library] - C++ 版本的序列分析函式庫 |
| 21 | * [http://biospice.sourceforge.net/ Bio-SPICE] - Biological Simulation Program for Intra- and Inter-Cellular Evaluation |
| 22 | * 在電子電機領域,SPICE 是非常重要的一套模擬軟體。Bio-SPICE 應該是一套希望在生物方面佔有一席之地的模擬軟體。 |
| 23 | * [http://bioera.net/ |
| 24 | * [https://sourceforge.net/projects/ncbiviewer/ NCBI Viewer] - [http://ncbiviewer.bravehost.com/ 新的官方網站] - NCBI |