Changes between Version 2 and Version 3 of biocluster/Bowtie


Ignore:
Timestamp:
Sep 15, 2009, 2:59:11 PM (15 years ago)
Author:
wade
Comment:

--

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified

  • biocluster/Bowtie

    v2 v3  
    22
    33= 【說明】 =
    4 
    54
    65= 【安裝】 =
    … …  
    109}}}
    1110
     11= 【路徑】 =
     12{{{
     13   /opt/bowtie
     14}}}
    1215
     16= 【測試】 =
     17{{{
     18   bowtie -f -m 1 -l 25 -n 2 gl_ref ./bowtie_test_reads.txt output.txt
     19}}}
    1320
    14 = 【執行】 =
     21= 【結果】 =
     22 * 輸出檔案：output.txt
    1523{{{
    16 
    17 
     241379_372_66_F3  +       scaffold00001  length=4743      2325    TTCTCAGTCAGTCTTCATGGCAGCA       IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII       0
     251380_574_1082_F3        +       scaffold00001  length=4743      502     TCCTCCACCGCACCTCCTCTCTCTC       IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII       0
     261380_770_1324_F3        -       scaffold00001  length=4743      378     AAGAGGAGAGAGCCGAGAGACGACT       IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII       0
     271380_1073_552_F3        +       scaffold00001  length=4743      843     CACCCAGACTGCGTTCCTTCAACAC       IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII       0
     281380_1389_821_F3        -       scaffold00001  length=4743      4304    TTTCACATGCACACGTCAACACCCA       IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII       0       23:A>T,24:A>T
     291380_1879_1685_F3       +       scaffold00001  length=4743      2081    TCCGAAATATCCTGCGGATCTTATT       IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII       0       2:T>C
    1830
    1931}}}