Changeset 92 for drbl-biocluster


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Timestamp:
Jul 8, 2009, 11:26:09 AM (15 years ago)
Author:
jazz
Message:
  • add path of torque, mpich2, mpiblast
File:
1 edited

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  • drbl-biocluster/BioCluster_Setup.sh

    r91 r92  
    146146  cd ..
    147147fi
     148
     149wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/mito.nt.gz
     150
     151cat > add_path << EOF
     152echo "export PATH=\\\$PATH:/opt/torque/bin:/opt/mpich2/bin:/opt/mpiblast/bin" >> /etc/profile
     153EOF
     154sudo sh add_path
     155
    148156#####################################################################
    149157# 電腦叢集的網頁監控機制
     
    156164  tar zxvf wwwblast-2.2.20-ia32-linux.tar.gz
    157165fi
     166#####################################################################
     167# 安裝 DRBL
     168#####################################################################
     169if [ ! -e GPG-KEY-DRBL ]; then
     170  wget http://drbl.nchc.org.tw/GPG-KEY-DRBL
     171  sudo apt-key add GPG-KEY-DRBL
     172  echo "deb http://free.nchc.org.tw/drbl-core drbl stable" > drbl.list
     173  sudo mv drbl.list /etc/apt/sources.list.d/
     174  sudo apt-get update
     175  sudo apt-get install drbl
     176  sudo /opt/drbl/sbin/drblsrv -i
     177  sudo /opt/drbl/sbin/drblpush -i
     178fi
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.