Changeset 92

Timestamp:

Jul 8, 2009, 11:26:09 AM (15 years ago)

Author:

jazz

Message:

• add path of torque, mpich2, mpiblast

File:

• drbl-biocluster/BioCluster_Setup.sh (modified) (2 diffs)

drbl-biocluster/BioCluster_Setup.sh

@@ -146 +146 @@
   cd ..
 fi
+
+wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/mito.nt.gz
+
+cat > add_path << EOF
+echo "export PATH=\\\$PATH:/opt/torque/bin:/opt/mpich2/bin:/opt/mpiblast/bin" >> /etc/profile
+EOF
+sudo sh add_path
+
 #####################################################################
 # 電腦叢集的網頁監控機制
@@ -156 +164 @@
   tar zxvf wwwblast-2.2.20-ia32-linux.tar.gz
 fi
+#####################################################################
+# 安裝 DRBL
+#####################################################################
+if [ ! -e GPG-KEY-DRBL ]; then
+  wget http://drbl.nchc.org.tw/GPG-KEY-DRBL
+  sudo apt-key add GPG-KEY-DRBL
+  echo "deb http://free.nchc.org.tw/drbl-core drbl stable" > drbl.list
+  sudo mv drbl.list /etc/apt/sources.list.d/
+  sudo apt-get update
+  sudo apt-get install drbl
+  sudo /opt/drbl/sbin/drblsrv -i
+  sudo /opt/drbl/sbin/drblpush -i
+fi