wiki:YMU110509

Version 14 (modified by jazz, 13 years ago) (diff)

--

雲端運算技術與生物資訊應用
Cloud Computing Technologies and its Bioinformatics Applications

課程資訊 Course Info.

  • 上課時間: 2011/05/09 (一) ~ 2011/06/06 (一) 15:30 ~ 17:20
  • Date and Time: 15:30 to 17:20, from 9 May 2011 to 6 June 2011, every Monday
  • 上課地點: 陽明大學 圖資大樓 電腦教室 R401
  • Location: R401 PC Room, Library and Information Building, Natioanl Yang-Ming University
  • 系所公告:http://bmi.ym.edu.tw/wp/?p=4532

線上討論 Web IRC chatroom

課程大綱 Course Outline

時段
Date
分類
Section
課程內容 Topics 投影片
Slides
實作
Hands-On
補充資料
Notes
05/09 Introduction - 高速運算於生物資訊之應用
- HPC for Bioinformatics
- PC Cluster 101
- 平行運算程式的種類
- Parallel Programming Model
part-1
part-2
實作一
實作二
Intel 談多核心的重要性
關於 Amdahl’s Law
05/16 Introduction - Cloud Computing Architecture
- Introduction to Hadoop
- Hadoop Distributed File System
- Hands-on: HDFS commands
part-3
part-4
實作三
實作四
05/23 Hands-On - MapReduce Algorithm
- Hands-on: Running MapReduce Examples
- Hadoop 相關專案簡介
- Introduction to Hadoop Ecosystem
part-4
part-5
實作五
實作六
不同語言的 MapReduce 實作
05/30 Hands-On - 大型網站架構與 HBase 分散式資料庫
- Large Scale Website and HBase distributed datastore
- Pig 簡介
- Introduction to Pig
part-5
part-6
實作七
實作八
06/06 Hands-On - Bioinformatics Apps using Hadoop
- Hands-on: CloudBurst, Crossbow, Contrail

Attachments (8)