Hypertable應用於BioInfo Project

• ​陽明生物資訊合作計畫
• 以陽明的病人屬性分類資料為範本來建立搜尋引擎
  • 參考資料:
    • ​待解問題1
    • ​轉檔程式
  • 匯入方式:
    將陽明的病人屬性分類資料(XML格式),轉換成Hypertable可批次讀取的TSV格式,再使用HQL指令載入到Hypertable當中
  • 匯出方式:
    使用HQL指令匯出TSV檔案
  • 搜尋方式:
    目前Hypertable只提供以Rowkey完全比對及Rowkey或Timestamp的區間比對,以陽明的範例為例:
    Source是指檢查之前診斷判定的病因;
    Primary Site是指檢查之後診斷判定的病因;
    如果用Source為Rowkey來搜尋"Breast",搜尋結果會查出所有Source為"Breast"的資料
    如果用Primary Site為Rowkey來搜尋"Breast",搜尋結果會查出所有Primary Site為"Breast"的資料
    
    • NOTE: 交互比對的部份,Hypertable目前似乎沒提供,這個有可能要另外的程式再來處理過