| | 1 | == Hypertable應用於BioInfo Project == |
| | 2 | * [http://trac.nchc.org.tw/grid/wiki/BioInfo_Project 陽明生物資訊合作計畫] |
| | 3 | * 以陽明的病人屬性分類資料為範本來建立搜尋引擎 |
| | 4 | * 參考資料: |
| | 5 | * [http://trac.nchc.org.tw/grid/wiki/BioInfo_Project/2008-03-19 待解問題1] |
| | 6 | * [http://trac.nchc.org.tw/grid/wiki/BioInfo_Project/2008-04-10 轉檔程式] |
| | 7 | * 匯入方式:[[BR]] |
| | 8 | 將陽明的病人屬性分類資料(XML格式),轉換成Hypertable可批次讀取的TSV格式,再使用HQL指令載入到Hypertable當中 |
| | 9 | * 匯出方式:[[BR]] |
| | 10 | 使用HQL指令匯出TSV檔案 |
| | 11 | * 搜尋方式:[[BR]] |
| | 12 | 目前Hypertable只提供以Rowkey完全比對及Rowkey或Timestamp的區間比對,以陽明的範例為例:[[BR]] |
| | 13 | Source是指檢查之前診斷判定的病因;[[BR]] |
| | 14 | Primary Site是指檢查之後診斷判定的病因;[[BR]] |
| | 15 | 如果用Source為Rowkey來搜尋"Breast",搜尋結果會查出所有Source為"Breast"的資料[[BR]] |
| | 16 | 如果用Primary Site為Rowkey來搜尋"Breast",搜尋結果會查出所有Primary Site為"Breast"的資料[[BR]] |
| | 17 | * NOTE: 交互比對的部份,Hypertable目前似乎沒提供,這個有可能要另外的程式再來處理過 |
