Changes between Version 3 and Version 4 of jazz/11-05-04

Timestamp:

May 4, 2011, 1:56:18 AM (13 years ago)

Author:

jazz

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jazz/11-05-04

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 ~/velvet_1.1.03$ ./velveth output 17 -fasta -short data/test_long.fa
 ~/velvet_1.1.03$ ./velvetg output/ -exp_cov 3 -min_contig_lgth 100
+}}}
+ * 使用 [http://packages.debian.org/valgrind valgrind] 來進行記憶體分析
+{{{
+~/velvet_1.1.03$ sudo apt-get install valgrind
+~/velvet_1.1.03$ valgrind -v --leak-check=full --show-reachable=yes ./velveth output 17 -fasta -short data/test_long.fa 2> velveth.log
+~/velvet_1.1.03$ valgrind -v --leak-check=full --show-reachable=yes ./velvetg output/ -exp_cov 3 -min_contig_lgth 100 2> velvetg.log
 }}}
  * 使用 gprof 進行 profile 分析