2009-05-19

• [專案] 陽明生物資訊計算叢集設定
  • 上次遇到 firmware-bnx2 的問題，在 Debian Lenny 上無法正常重建網路開機環境，因此改用 Ubuntu 9.04 進行網路安裝，過程很順利。
  • 硬碟 I/O 很慢的主因是有做硬體 RAID，而且持續在做 SYNC 的動作，因此只要把 RAID 卡關掉就可以比較快速地開進作業系統。
  • 參考​Lustre on Debian，在 Ubuntu 9.04 上編譯 Lustre 核心模組。
  • [失敗] 因為 Lustre 目前官方只支援到 2.6.22，因此無法 patch 產生 2.6.28 的核心模組。

    ~$ sudo apt-get update
    ~$ sudo apt-get install linux-patch-lustre lustre-source linux-source kernel-package
    ~$ cd /usr/src
    /usr/src$ sudo tar jxvf linux-source-2.6.28.tar.bz2
    /usr/src$ cd linux-source-2.6.28/
    /usr/src/linux-source-2.6.28$ sudo cp /boot/config-2.6.28-11-generic .config
    /usr/src/linux-source-2.6.28$ sudo make oldconfig
    /usr/src/linux-source-2.6.28$ sudo su
    /usr/src/linux-source-2.6.28# tar jxvf ../lustre.tar.bz2
    /usr/src/linux-source-2.6.28# export CONCURRENCY_LEVEL=3
    /usr/src/linux-source-2.6.28# make-kpkg clean
    /usr/src/linux-source-2.6.28# make-kpkg --rootcmd fakeroot --added-patches=lustre --initrd --append-to-version "-lustre-1.6.5.1-4" --revision=20090519 kernel_image
    

Mobile Computing

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