wiki:jazz/09-04-13

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2009-04-13

  • [陽明] 安裝 R ape 套件,剛開始的錯誤訊息是找不到 stdio.h, stdlib.h, math.h 這些,所以必須裝 libc6-dev 才會有這些檔案。另外,編譯過程中有遇到一些錯誤(找不到 -lgfortran 跟 -llapack),是因為相依 gfortran 跟 liblapack-dev。
    libc6-dev: /usr/include/bits/stdio.h
    libc6-dev: /usr/include/stdlib.h
    libc6-dev: /usr/include/math.h
    
    liblapack-dev: /usr/lib/liblapack.a
    
    gfortran-4.3: /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.3/libgfortran.a
    
    • [備忘] 安裝步驟:
      # apt-get install libc6-dev gfortran liblapack-dev
      # wget http://cran.r-project.org/src/contrib/gee_4.13-13.tar.gz
      # R CMD INSTALL gee_4.13-13.tar.gz
      # wget http://cran.r-project.org/src/contrib/nlme_3.1-90.tar.gz
      # R CMD INSTALL nlme_3.1-90.tar.gz
      # wget http://cran.r-project.org/src/contrib/lattice_0.17-22.tar.gz
      # R CMD INSTALL lattice_0.17-22.tar.gz
      # wget http://cran.r-project.org/src/contrib/ape_2.3.tar.gz
      # R CMD INSTALL ape_2.3.tar.gz
      
  • FirePHP - 搭配 Server-Side 的語法,可以在 Firefox 的 FirePHP 擴充套件上顯示 DEBUG Log 資訊。
  • 曾跟 Cloudera 的 Christophe 提過翻譯錄影的字幕,不過不確定 Vimeo 是否有支援,需要評估一下。另外,除了 YouTube 以外,還有很多支援字幕的網站,如: dotSUB

Parallel : MPI Bindings

  • 當然 Erlang 被視為比 MPI 更容易實作分散/平行化的一種語言,這裡有兩篇參考文章12

Bioinformatics HPC

eyeOS