= BLAST = * http://www.ncbi.nih.gov/BLAST/ * Debian 套件: [http://packages.debian.org/blast2 blast2] = 【安裝】 = {{{ apt-get install blast2 }}} = 【測試】 = 資料庫: * ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/ * ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/blast-2.2.21-ia32-linux.tar.gz 1. 指令: {{{ formatdb -i nt.ests -p F -o T -n test.nt }}} 輸出檔案:bl2seq.out 1. 指令: {{{ formatdb -i nt.ests -p F -o T -n test.nt }}} 輸出檔案: * test.nt.nhr test.nt.nsd * test.nt.nin test.nt.nsi * test.nt.nnd test.nt.nsq * test.nt.nni formatdb.log 1. 指令: {{{ fastacmd -d test.nt -s 5986 }}}