Changes between Version 5 and Version 6 of biocluster/BLAST

Timestamp:

Sep 16, 2009, 12:51:16 PM (16 years ago)

Author:

wade

Comment:

--

biocluster/BLAST

@@ -3 +3 @@
  * http://www.ncbi.nih.gov/BLAST/
  * Debian 套件: [http://packages.debian.org/blast2 blast2]
-
-
-= 【說明】 =
-
-
 
 = 【安裝】 =
@@ -14 +9 @@
 }}}
 
-
-
-= 【執行】 =
-
-
-
 = 【測試】 =
 資料庫：
  * ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/
  * ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/blast-2.2.21-ia32-linux.tar.gz
+
+ 1. 指令：
+    {{{
+formatdb -i nt.ests -p F -o T -n test.nt
+    }}}
+    輸出檔案：bl2seq.out
+ 1. 指令：
+    {{{
+formatdb -i nt.ests -p F -o T -n test.nt
+    }}}
+    輸出檔案：
+      * test.nt.nhr  test.nt.nsd
+      * test.nt.nin  test.nt.nsi
+      * test.nt.nnd  test.nt.nsq
+      * test.nt.nni  formatdb.log
+ 1. 指令：
+    {{{
+fastacmd -d test.nt -s 5986
+    }}}
+