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實作九： World Community Grid 帳號申請實作

}}} [[PageOutline]] ◢ <[wiki:YM_Course_2009/Lab8 實作八]> | <[wiki:YM_Course_2009 回課程大綱]> ▲ | <[wiki:YM_Course_2009/Lab10 實作十]> ◣ = 架設 BOINC Server = BOINC Server 的架設方式有兩種: 1. 使用 [http://boinc.berkeley.edu/trac/wiki/VirtualMachines BOINC 團隊提供的 VMWare Image] 進行測試 * Linux 上如果遇到權限問題, 請確認解壓縮之後, vmx 檔案是否具備執行權限(Execution) * [狀況] 使用 [http://boincdl.ssl.berkeley.edu/dl/debian-40r0-i386-boinc.zip Berkeley Debian Etch 4.0r0 32bit], 網路卡一直無法正常啟動, 故轉而使用自行製作的 vmware image. 2. 從 BOINC 官方 SVN 下載原始碼編譯並自行安裝相關套件 * 使用自製 Debian Etch 4.0r0 版本的 Xen VM 並執行[#自行安裝以下]的步驟 == 使用 BOINC 官方 VMWare Image == 根據[http://boinc.berkeley.edu/trac/wiki/VirtualMachines 官方文件]的說明, 安裝 BONIC Server 最容易的方法是安裝[http://www.vmware.com/download/player/ VMWare player] (免費軟體/freeware)。目前有兩個 VMWare Image 可以下載: * [http://boincdl.ssl.berkeley.edu/dl/debian-40r0-i386-boinc.zip Berkeley BOINC 團隊提供的 VMWare Image - Debian Etch 4.0r0 32bit] * [http://boincdl.ssl.berkeley.edu/dl/ubuntu-server-7.04-i386-boinc.zip Berkeley BOINC 團隊提供的 VMWare Image - Ubuntu Feisty 7.04 32-bit] == 自行安裝 == === 前置作業 === * 以下的步驟是在 Xen 的環境下完成, Xen 的安裝步驟請參考 [wiki:Xen_Installation Xen Installation How-To] * '''前置作業''': 建立 BOINC Server Xen VM (Etch) {{{ xen-server:~# xen-create-image -dir /home/xen --dist etch --debootstrap --fs reiserfs --accounts --kernel /boot/vmlinuz-2.6.18-6-xen-vserver-amd64 --initrd /boot/initrd.img-2.6.18-6-xen-vserver-amd64 --hostname boinc-server --ip 140.110.X.X --gateway 140.110.X.X --netmask 255.255.255.0 --mirror http://free.nchc.org.tw/debian xen-server:~# xm create /etc/xen/boinc-server.cfg xen-server:~# xm list Name ID Mem(MiB) VCPUs State Time(s) Domain-0 0 1878 4 r----- 1478.4 bonic-server 1 128 1 -b---- 1035.7 }}} * 使用 root 帳號登入, 別忘了要設定密碼喔!! 否則用 xen-create-image 產生 VM 時請記得加 --passwd {{{ xen-server:~# xm console bonic-server boinc-server login: root boinc-server:~# passwd }}} === 安裝 BOINC Server 相關軟體 === * [參考文獻] [http://boinc.berkeley.edu/trac/wiki/ServerIntro#cookbook-debian40 Cookbook for Debian 4.0] * * BOINC Server 基本的套件需求 {{{ boinc-server:~# apt-get update boinc-server:~# apt-get upgrade boinc-server:~# apt-get install m4 make autoconf automake gcc g++ pkg-config libtool subversion vim apache2-mpm-prefork libapache2-mod-php5 mysql-server mysql-client-5.0 mysql-client-5.0 php5-mysql php5-cli php5-gd phpmyadmin python-mysqldb libmysql++-dev libssl-dev libphp-phpmailer }}} * [備註] libphp-phpmailer - 供 BOINC 專案註冊帳號寄信用 (參考 Linux Magazine Issue 71 October 2006 "Building distributed application with BOINC"([http://www.linux-magazine.com/issue/71/Distributed_Applications_With_BOINC.pdf PDF Download])) * 建立 BOINC 管理者帳號 {{{ boinc-server:~# adduser boincadm }}} * 修改 MySQL Server 預設 root 密碼 {{{ boinc-server:~# mysql_install_db boinc-server:~# mysqladmin -h localhost -u root password '新的 MySQL Root 密碼' }}} * 建立 BOINC SQL 管理者 boincadm 權限 {{{ boinc-server:~# mysql -h localhost -u root -p mysql> GRANT ALL ON *.* TO 'boincadm'@'localhost'; mysql> SET PASSWORD FOR 'boincadm'@'localhost'=''; mysql> quit }}} * 編譯 BOINC 原始檔 {{{ boinc-server:~# svn co http://boinc.berkeley.edu/svn/trunk/boinc boinc_trunk boinc-server:~# cd ~/boinc_trunk boinc-server:~/boinc_trunk# svn update boinc-server:~/boinc_trunk# ./_autosetup boinc-server:~/boinc_trunk# ./configure --disable-client --enable-unicode --without-x boinc-server:~/boinc_trunk# make }}} * 建立 BOINC Project 範例 {{{ boinc-server:~# cd ~/boinc_trunk/tools boinc-server:~/boinc_trunk/tools# ./make_project --url_base http://140.110.X.X/ --db_host localhost --db_user boincadm --project_root /var/www/boinc_projects --delete_prev_inst --drop_db_first --test_app bioinfo boinc-server:~/boinc_trunk/tools# chown -R www-data:www-data /var/www/boinc_projects boinc-server:~/boinc_trunk/tools# cd /var/www/boinc_projects boinc-server:/var/www/boinc_projects# cp bioinfo.httpd.conf /etc/apache2/sites-available/bioinfo boinc-server:/var/www/boinc_projects# ln -s /etc/apache2/sites-available/bioinfo /etc/apache2/sites-enabled/bioinfo boinc-server:/var/www/boinc_projects# apache2ctl -t boinc-server:/var/www/boinc_projects# apache2ctl restart boinc-server:/var/www/boinc_projects# cat bioinfo.cronjob >> /var/spool/cron/crontabs/root }}} * 由於範例專案預設不能申請帳號, 因此要把 disable_account_creation 的選項改為 0 {{{ #!diff --- /var/www/boinc_projects/config.xml.org 2008-04-29 12:27:35.000000000 +0000 +++ /var/www/boinc_projects/config.xml 2008-04-29 11:54:40.000000000 +0000 @@ -17,7 +17,7 @@ 3 - 1 + 0 1024 }}} * 修改 project.xml 架構設定檔：可只留下 i686 Linux 跟 x86_64 Linux 兩種版本，也就是預設只有 Linux 32 位元跟 64 位元兩種 CPU 架構可以執行 uppercase 範例專案（與下一個步驟有關） {{{ #!diff --- /var/www/boinc_projects/project.xml.org 2008-05-07 18:49:53.000000000 -0700 +++ /var/www/boinc_projects/project.xml 2008-05-07 18:50:23.000000000 -0700 @@ -1,13 +1,5 @@ - windows_intelx86 - Microsoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU - - - windows_x86_64 - Microsoft Windows running on an AMD x86_64 or Intel EM64T CPU - - i686-pc-linux-gnu Linux running on an Intel x86-compatible CPU @@ -15,34 +7,6 @@ x86_64-pc-linux-gnu Linux running on an AMD x86_64 or Intel EM64T CPU - - powerpc-apple-darwin - Mac OS X 10.3 or later running on Motorola PowerPC - - - i686-apple-darwin - Mac OS 10.4 or later running on Intel - - - sparc-sun-solaris2.7 - Solaris 2.7 running on a SPARC-compatible CPU - - - sparc-sun-solaris - Solaris 2.8 or later running on a SPARC-compatible CPU - - - sparc64-sun-solaris - Solaris 2.8 or later running on a SPARC 64-bit CPU - - - powerpc64-ps3-linux-gnu - Sony Playstation 3 running Linux - - - anonymous - anonymous - uppercase upperCASE }}} * 確認範例專案的應用程式(BOINC Application)有 project.xml 中定義的二進位程式檔 {{{ boinc-server:/var/www/boinc_projects# cd apps/uppercase boinc-server:/var/www/boinc_projects/apps/uppercase# ls uppercase_1.1_i686-pc-linux-gnu boinc-server:/var/www/boinc_projects/apps/uppercase# mkdir -p uppercase_1.1_x86_64-pc-linux-gnu boinc-server:/var/www/boinc_projects/apps/uppercase# cp uppercase_1.1_i686-pc-linux-gnu/uppercase_1.1_i686-pc-linux-gnu uppercase_1.1_x86_64-pc-linux-gnu/uppercase_1.1_x86_64-pc-linux-gnu }}} * 注意：目錄的命名法則為『應用程式名稱_版本_CPU架構-作業系統』，而二進位程式檔的『版本』、『CPU架構』及『作業系統』都必須與目錄一致，也必須跟 project.xml 中寫的一致（參考 BOINC 官方網站註明的『已支援CPU架構、作業系統』），否則會在執行 bin/update_versions 時出現錯誤。 {{{ boinc-server:/var/www/boinc_projects# bin/update_versions Ignoring directory (no main program found - it has to be named the same as the directory) /var/www/boinc_projects/apps/uppercase/uppercase_1.1_x86_64-pc-linux-gnu No new versions found! }}} * 編輯專案網頁相關設定 html/project/project.inc {{{ #!diff --- project.inc.org 2008-05-07 19:33:47.000000000 -0700 +++ project.inc 2008-05-07 19:36:00.000000000 -0700 @@ -7,7 +7,7 @@ require_once("../inc/util.inc"); $master_url = parse_config(get_config(), ""); -define("PROJECT", "REPLACE WITH PROJECT NAME"); +define("PROJECT", "Bioinfo@Home"); define("URL_BASE", $master_url); define("IMAGE_PATH", "../user_profile/images/"); define("IMAGE_URL", "user_profile/images/"); @@ -15,14 +15,14 @@ define("PROFILE_URL", "user_profile/"); define("LANGUAGE_FILE", "languages.txt"); define("STYLESHEET", "white.css"); -define("COPYRIGHT_HOLDER", "REPLACE WITH COPYRIGHT HOLDER"); -define("SYS_ADMIN_EMAIL", "admin@$master_url"); -define("UOTD_ADMIN_EMAIL", "admin@$master_url"); +define("COPYRIGHT_HOLDER", "NCHC,Taiwan"); +define("SYS_ADMIN_EMAIL", "YOURNAME@NCHC.ORG.TW"); +define("UOTD_ADMIN_EMAIL", "YOURNAME@NCHC.ORG.TW"); // who gets user of the day pool running low e-mails? // Email addresses separated by pipe ( | ) that will receive user reported // offensive forum posts. -define("POST_REPORT_EMAILS", "moderator1@$master_url|moderator2@$master_url"); +define("POST_REPORT_EMAILS", "YOURNAME@NCHC.ORG.TW|YOURNAME2@NCHC.ORG.TW"); function project_banner($title) { // Put your project title and logo here }}} * 啟動範例專案 {{{ boinc-server:/var/www/boinc_projects# bin/xadd boinc-server:/var/www/boinc_projects# bin/update_versions boinc-server:/var/www/boinc_projects# bin/start boinc-server:/var/www/boinc_projects# bin/status }}} * 檢視 BOINC Project 範例 * 專案計畫首頁 - http://140.110.X.X/bioinfo * 專案管理首頁 - http://140.110.X.X/bioinfo_ops/ == 測試 BOINC Project 範例 == * STEP 1: 首先安裝 boinc-client {{{ boinc-client:~# apt-get install boinc-client }}} * STEP 2: 其次是前往 http://140.110.X.X/bioinfo/create_account_form.php 註冊帳號 * 取得 Account key , 例如: 8346cd95017b110ee2ecd88ed7734981 * [備註] 相同的資訊可以登入後, 在 http://140.110.X.X/bioinfo/home.php 取得 * 亦可使用命令列取得 Account key {{{ boinc-client:~# boinc_cmd --create_account http://140.110.X.X/bioinfo ${YOUR_EMAIL} "${YOUR_PASSWORD}" ${YOUR_ID} status: Success poll status: operation in progress poll status: operation in progress account key: 8346cd95017b110ee2ecd88ed7734981 }}} * STEP 3: 測試 boinc-client 登入 BOINC Project 範例 * [方法一] 直接執行 boinc {{{ boinc-client:~# boinc -attach_project http://140.110.X.X/bioinfo 8346cd95017b110ee2ecd88ed7734981 & ########################### 說明 ######################################### boinc-server:~# boinc -attach_project ${專案網址} ${線上申請到的_Account_key} & }}} * [方法二] 讓 boinc-client 跑在背景, 再用 boinc_cmd 去加入 project {{{ boinc-client:~# /etc/init.d/boinc-client start ##### 加入專案 ##### boinc-client:~# boinc_cmd --project_attach http://140.110.X.X/bioinfo 8346cd95017b110ee2ecd88ed7734981 ##### 取得狀態 ##### boinc-client:~# boinc_cmd --get_state ##### 離開專案 ##### boinc-client:~# boinc_cmd --project http://140.110.X.X/bioinfo detach }}} == 錯誤排除 == * [狀況一] 當 boinc client 加入專案後, 一直無法取得系統狀態. 查看 /var/lib/boinc_client/sched_replay_* 出現以下訊息 {{{ }}} * [參考] [http://scilincdev.blogspot.com/2006/12/boinc-server-shared-memory-error.html BOINC Server Shared Memory Error]